舍利大殿又稱佛殿層，距離地面33米，在空間上涵括了地宮第1、2、3層，內外又可分為千佛殿與萬佛廊，向人們集中呈現了一個神祕、殊勝的佛國世界。 這裡也有人可以帶領繞舍利大塔祈福，信眾可以跟隨。 千佛殿依照金剛界曼荼羅第四供養會設計而成，整座大殿共有佛、菩薩1343尊，再現了佛與菩薩相互供養的神聖場景。其中，大殿正中為象徵大日如來的舍利大塔，大塔的東南西北四個方向為四方佛（東方阿閦佛、南方寶生佛、西方阿彌陀佛、北方不空成就佛），大殿牆壁上為慧門十六尊、八內外供養等菩薩。 內部空間極高，精美的穹頂就在上方